Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7A4

Gm21560, Predicted gene, 21560, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21560D3Z7A4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21560D3Z7A4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21560D3Z7A4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21560D3Z7A4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21560D3Z7A4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21560D3Z7A4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21560D3Z7A4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21560D3Z7A4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21560D3Z7A4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21560D3Z7A4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21560D3Z7A4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21560D3Z7A4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21560D3Z7A4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21560D3Z7A4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21560D3Z7A4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21560D3Z7A4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21560D3Z7A4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms