Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms