Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
3425401B19RikD3Z1D3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
3425401B19RikD3Z1D3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC27■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
3425401B19RikD3Z1D3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms