Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc8D3YZV8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc8D3YZV8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms