Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc6D3YZP9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc6D3YZP9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms