Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc170D3YXL0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc170D3YXL0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms