Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SafbD3YXK2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SafbD3YXK2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms