Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cldn24D3YXJ9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn24D3YXJ9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms