Protein–RNA interactions for Protein: D3YV89

Mmp27, Matrix metalloproteinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp27D3YV89 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Mmp27D3YV89 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp27D3YV89 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms