Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ptprz1B9EKR1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprz1B9EKR1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms