Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Nxpe3B9EKK6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nxpe3B9EKK6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms