Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mterf1bB9EJ57 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mterf1bB9EJ57 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms