Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Phf11bB4XVQ1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Phf11bB4XVQ1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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