Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Phf11cB4XVP9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Phf11cB4XVP9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms