Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc11B2RXC1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc11B2RXC1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms