Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Siah3B2RWG3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Siah3B2RWG3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms