Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usf3B2RUQ2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usf3B2RUQ2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms