Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Prrt4B2RU40 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prrt4B2RU40 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms