Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Znf518bB2RRE4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Znf518bB2RRE4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Znf518bB2RRE4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Znf518bB2RRE4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Znf518bB2RRE4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Znf518bB2RRE4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Znf518bB2RRE4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Znf518bB2RRE4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Znf518bB2RRE4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Znf518bB2RRE4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Znf518bB2RRE4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Znf518bB2RRE4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Znf518bB2RRE4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Znf518bB2RRE4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Znf518bB2RRE4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Znf518bB2RRE4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Znf518bB2RRE4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Znf518bB2RRE4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Znf518bB2RRE4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Znf518bB2RRE4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Znf518bB2RRE4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Znf518bB2RRE4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Znf518bB2RRE4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Znf518bB2RRE4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Znf518bB2RRE4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Znf518bB2RRE4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf518bB2RRE4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf518bB2RRE4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf518bB2RRE4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf518bB2RRE4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf518bB2RRE4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms