Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU6

Gm436, Predicted gene 436, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm436B1AVU6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm436B1AVU6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm436B1AVU6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm436B1AVU6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm436B1AVU6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm436B1AVU6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm436B1AVU6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm436B1AVU6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm436B1AVU6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm436B1AVU6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm436B1AVU6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm436B1AVU6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm436B1AVU6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm436B1AVU6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm436B1AVU6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm436B1AVU6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm436B1AVU6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm436B1AVU6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm436B1AVU6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm436B1AVU6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm436B1AVU6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm436B1AVU6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm436B1AVU6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm436B1AVU6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm436B1AVU6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm436B1AVU6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm436B1AVU6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms