Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prr29B1ARI9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prr29B1ARI9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms