Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem238A9JSM3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tmem238A9JSM3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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