Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Skint4A7TZF3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skint4A7TZF3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skint4A7TZF3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skint4A7TZF3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Skint4A7TZF3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Skint4A7TZF3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skint4A7TZF3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skint4A7TZF3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skint4A7TZF3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skint4A7TZF3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skint4A7TZF3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skint4A7TZF3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skint4A7TZF3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skint4A7TZF3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skint4A7TZF3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Skint4A7TZF3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Skint4A7TZF3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms