Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Odf2A3KGV1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Odf2A3KGV1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms