Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ism1A2ATD1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ism1A2ATD1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms