Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itga8A2ARA8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itga8A2ARA8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms