Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rtf1A2AQ19 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtf1A2AQ19 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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