Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Syndig1A2ANU3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syndig1A2ANU3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms