Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SetxA2AKX3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SetxA2AKX3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms