Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc183A2AJB1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc183A2AJB1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc183A2AJB1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms