Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc163A2AGD7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc163A2AGD7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms