Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frmpd4A2AFR3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Frmpd4A2AFR3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Frmpd4A2AFR3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms