Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprfA2A8L5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprfA2A8L5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms