Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm6268A2A3U9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm6268A2A3U9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms