Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2l1A2A259 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2l1A2A259 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2l1A2A259 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2l1A2A259 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2l1A2A259 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pkd2l1A2A259 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2l1A2A259 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2l1A2A259 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2l1A2A259 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2l1A2A259 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2l1A2A259 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2l1A2A259 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2l1A2A259 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2l1A2A259 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2l1A2A259 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pkd2l1A2A259 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd2l1A2A259 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms