Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc173A0JLY1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc173A0JLY1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms