Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Trbv26A0A0B4J1P5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Trbv26A0A0B4J1P5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trbv26A0A0B4J1P5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trbv26A0A0B4J1P5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trbv26A0A0B4J1P5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trbv26A0A0B4J1P5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trbv26A0A0B4J1P5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trbv26A0A0B4J1P5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trbv26A0A0B4J1P5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trbv26A0A0B4J1P5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trbv26A0A0B4J1P5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trbv26A0A0B4J1P5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Trbv26A0A0B4J1P5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trbv26A0A0B4J1P5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv26A0A0B4J1P5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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