Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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