Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H3

Trbv16, T cell receptor beta, variable 16 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv16A0A0B4J1H3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trbv16A0A0B4J1H3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trbv16A0A0B4J1H3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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