Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trbv21A0A0A6YX06 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trbv21A0A0A6YX06 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms