Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm11688-201ENSMUST00000122145 308 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm28239-201ENSMUST00000190225 447 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm26730-201ENSMUST00000181270 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm28077-201ENSMUST00000190250 1635 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm6729-201ENSMUST00000165173 1452 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm26182-201ENSMUST00000157688 116 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Nxf1-205ENSMUST00000183939 1017 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm31881-202ENSMUST00000199455 559 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 D130017N08Rik-204ENSMUST00000199836 506 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm18207-201ENSMUST00000205486 526 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 4933409F18Rik-201ENSMUST00000221910 1267 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Gm24046-201ENSMUST00000083111 165 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ChmQ9QXG2 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms