Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm7978-202ENSMUST00000201129 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 BC061212-201ENSMUST00000094587 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm14692-201ENSMUST00000114672 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm1140-201ENSMUST00000114675 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm11649-201ENSMUST00000118214 375 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm12604-201ENSMUST00000118382 380 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Snrp1c-ps2-201ENSMUST00000120976 365 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Tmsb10-204ENSMUST00000144337 433 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Mir6999-201ENSMUST00000183498 61 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm38289-201ENSMUST00000194273 597 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm43479-201ENSMUST00000200801 529 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm3604-203ENSMUST00000202194 736 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Mcee-204ENSMUST00000206882 391 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 AC127254.1-201ENSMUST00000216563 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 9230104L09Rik-201ENSMUST00000028937 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 6720489N17Rik-201ENSMUST00000091563 318 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Zfyve9-201ENSMUST00000042185 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
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Rabgef1Q9JM13 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Tmem177-201ENSMUST00000037906 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Wac-202ENSMUST00000092112 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Psma8-201ENSMUST00000040860 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Efcab9-202ENSMUST00000109377 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Churc1-202ENSMUST00000110399 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm14879-201ENSMUST00000117308 507 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm12310-201ENSMUST00000118013 492 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm13458-201ENSMUST00000118239 367 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Gm14519-201ENSMUST00000118490 312 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rabgef1Q9JM13 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
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