Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Mars2-201ENSMUST00000061334 11294 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Birc2-204ENSMUST00000190341 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Pgr15l-201ENSMUST00000033556 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d24-202ENSMUST00000040474 6269 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Lama1-201ENSMUST00000035471 9518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Pogk-203ENSMUST00000131487 8692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Med12-202ENSMUST00000087956 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Edar-201ENSMUST00000003312 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 CT025642.2-201ENSMUST00000225009 1649 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm43323-201ENSMUST00000202328 4258 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Mx1-201ENSMUST00000023655 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Wipf3-206ENSMUST00000172046 4204 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Olfr981-202ENSMUST00000215956 8197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
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Col5a3Q9JLI2 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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Col5a3Q9JLI2 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Eif4g2-213ENSMUST00000162415 7995 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Smpd4-203ENSMUST00000090159 4565 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Col5a3Q9JLI2 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Rps6ka6-201ENSMUST00000065976 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Col5a3Q9JLI2 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Prpf8-202ENSMUST00000102510 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Znfx1-202ENSMUST00000067584 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Grk3-201ENSMUST00000065167 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Col5a3Q9JLI2 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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Col5a3Q9JLI2 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Col5a3Q9JLI2 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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