Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrc9Q8CDN9 Thrb-202ENSMUST00000022304 6200 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Lrrc9Q8CDN9 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrc9Q8CDN9 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Lrrc9Q8CDN9 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Lrrc9Q8CDN9 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Lrrc9Q8CDN9 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Lrrc9Q8CDN9 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lrrc9Q8CDN9 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Lrrc9Q8CDN9 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Lrrc9Q8CDN9 Mtmr4-203ENSMUST00000119628 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Lrrc9Q8CDN9 Zfp939-202ENSMUST00000186855 2480 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc9Q8CDN9 Snrnp200-201ENSMUST00000103220 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc9Q8CDN9 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lrrc9Q8CDN9 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Lrrc9Q8CDN9 Map1a-202ENSMUST00000110639 10145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Lrrc9Q8CDN9 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc9Q8CDN9 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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Lrrc9Q8CDN9 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Lrrc9Q8CDN9 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc9Q8CDN9 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc9Q8CDN9 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Lrrc9Q8CDN9 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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