Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 Frrs1-202ENSMUST00000195905 6823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 Spag11b-202ENSMUST00000110767 1740 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 Gm36993-201ENSMUST00000192983 2980 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ube2q1Q7TSS2 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 4931406P16Rik-210ENSMUST00000206399 4158 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Vma21-203ENSMUST00000114577 4652 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Eif4e2-207ENSMUST00000113235 3473 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Spag9-201ENSMUST00000024979 6756 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ube2q1Q7TSS2 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms