Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm13269-201ENSMUST00000143458 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 1700008B11Rik-201ENSMUST00000198145 634 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Tmem225-201ENSMUST00000046333 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm16409-201ENSMUST00000100510 747 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Igkv8-28-201ENSMUST00000103380 305 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Smim23-202ENSMUST00000109365 331 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm7803-201ENSMUST00000117176 1015 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm9143-201ENSMUST00000120745 745 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm12514-201ENSMUST00000142782 568 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm27288-201ENSMUST00000184215 80 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm38289-201ENSMUST00000194273 597 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm9689-201ENSMUST00000210009 428 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 AC127254.1-201ENSMUST00000216563 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
CtifQ6PEE2 4930471E19Rik-202ENSMUST00000219150 737 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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