Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 AL713985.1-201ENSMUST00000219030 420 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PcolceQ61398 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms