Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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Rnf149Q3U2C5 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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Rnf149Q3U2C5 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Rnf149Q3U2C5 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Rnf149Q3U2C5 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnf149Q3U2C5 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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