Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Mir675-201ENSMUST00000102320 84 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm26012-201ENSMUST00000104411 128 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm11951-201ENSMUST00000116005 431 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm14056-201ENSMUST00000117198 642 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm14225-201ENSMUST00000142310 539 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Bud31-207ENSMUST00000162594 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm4252-201ENSMUST00000174823 313 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Tpi-rs11-201ENSMUST00000202145 310 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm34006-201ENSMUST00000213985 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 AC105950.2-201ENSMUST00000220938 368 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Irx2P81066 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Irx2P81066 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm23659-201ENSMUST00000102245 110 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Milr1-203ENSMUST00000147326 1234 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm23598-201ENSMUST00000157262 144 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm20406-201ENSMUST00000173993 423 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Krtap22-2-201ENSMUST00000178913 380 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Mir6999-201ENSMUST00000183498 61 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm28115-201ENSMUST00000188985 360 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm17978-201ENSMUST00000195986 769 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm23786-202ENSMUST00000200181 119 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm45672-201ENSMUST00000209700 768 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm45388-202ENSMUST00000211101 815 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 AC158799.1-201ENSMUST00000214686 617 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Irx2P81066 AC126939.2-201ENSMUST00000225989 307 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms