Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm18353-201ENSMUST00000185906 784 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 1700036G14Rik-201ENSMUST00000189046 542 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm37929-201ENSMUST00000195116 493 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm37904-201ENSMUST00000195591 312 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Ighv8-16-201ENSMUST00000199258 294 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Ceacam1-204ENSMUST00000205308 993 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Rtp4-203ENSMUST00000210901 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 AC122539.2-201ENSMUST00000220207 404 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Aamdc-201ENSMUST00000042627 627 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 EU599041-203ENSMUST00000205748 1492 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
VdrP48281 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
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VdrP48281 3110009F21Rik-201ENSMUST00000223217 1625 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Mir5623-201ENSMUST00000176631 70 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm27224-201ENSMUST00000184749 564 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Plet1-202ENSMUST00000188047 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
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VdrP48281 Gm37185-201ENSMUST00000193852 410 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Ighv10-2-201ENSMUST00000195182 298 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm42525-201ENSMUST00000196257 527 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Olfr320-201ENSMUST00000204718 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Nxpe1-ps-202ENSMUST00000210160 956 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 CT033774.2-201ENSMUST00000222079 256 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
VdrP48281 AC241621.1-201ENSMUST00000224499 430 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
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